近5年获国家重点研发计划课题、国家科技支撑计划课题、国家基金重点项目、国家杰出（优秀）青年基金、国家基金重大国际（地区）合作研究、教育部创新团队、国家基金面上（青年）项目等一批国家级及省部级项目，总经费超1亿元；近年来，学院发挥学科优势，积极承担了福建省沿海市县综合风险评估与区划工作、福建省资源与环境五年计划及中长期科技发展规划，福建省生态功能、主体功能区划，福建省土地利用总体规划修编试点研究，福建省重点港湾海域使用规划，全省土壤污染大调查，海洋资源价值绿色评估及其应用，福建省林业保护利用规划，福建省生态十年变化遥感调查与评估，福州（平潭）综合试验区的生态建设与环境保护规划等一系列横向课题任务，合同经费超8000万元。

5年来，学院教师在Nature，Nature Communications， PNAS，Global Change Biology，New Phytologist, Environmental Science and Technology，Soil Biology and Biochemistry, Plant and Soil 等国际期刊发表SCI、EI论文400余篇。出版专著16部，获发明专利12项，制定国家标准2项、福建省地方标准1项。学院获省部级奖34项，其中一等奖6项，二等奖10项，三等奖18项。