目前,学院形成比较完备的学科和支撑体系。拥有地理学、生态学两个一级学科博士点和两个博士后科研流动站,设有自然地理学、人文地理学、地图学与地理信息系统、自然资源学、城市与区域规划、水土保持、生态学等7个二级学科博士点,自然地理学、人文地理学、地图学与地理信息系统、自然资源学、城市与区域规划、生态学、土地资源管理、学科教学(地理)等8个硕士点;地理科学、地理信息科学(含闽台合作项目)、自然地理与资源环境、人文地理与城乡规划(含闽台合作项目)、生态学等5个本科专业和1个地理学国家理科基础科学研究与教学人才培养基地。学院下设地理学系、资源与城市规划系、地球信息科学系、生态环境系、地理学国家理科基地建设办公室等5个教学工作单位。

    学院建设有高水平的教学科研支撑平台。教学支撑平台有国家级地理学实验教学示范中心,国家级大学生校外实践教育基地(福建师范大学--福建武夷山国家级自然保护区国家理科实践教育基地),福建省高校人文社会科学研究基地(福建师范大学生态文明科学研究中心)、福建省地理学实验教学示范中心、福建省综合地理学实验教学示范中心。科研支撑平台有省属公益类事业法人单位-福建师范大学地理研究所,湿润亚热带山地生态重点实验室省部共建国家重点实验室培育基地、湿润亚热带生态-地理过程教育部重点实验室、福建三明森林生态系统与全球变化国家野外科学观测研究站、福建闽江河口湿地生态系统定位观测研究站(国家林业局)、福建省陆地灾害监测评估工程技术研究中心、福建省森林碳计量技术开发应用工程研究中心、福建省亚热带资源与环境重点实验室、福建省植物生理生态重点实验室、福建省资源环境与绿色发展研究中心(智库)、三明森林生态系统与全球变化福建省野外科学研究站、闽江河口湿地福建省野外科学研究站、福建省河湖健康研究中心等国家级、省部级平台;校属城乡规划研究所、生态文明研究所,旅游研究所、全球变化研究中心、自然资源研究中心、亚热带湿地研究中心、地球信息科学研究中心、人口与发展研究中心等教学科研单位。《亚热带资源与环境学报》(Journal of Subtropical Resources and Environment)编辑部、福建省地理学会、自然资源学会、天文学会、生态文明研究会、教育学会地理教学研究会挂靠学院。